Integrering med automake
Kopiera först Makefile.am från underkatalogen examples från gtkdoc-sources till ditt projekts API-dokumentationskatalog ( ./docs/reference/<paket>). En lokal kopia bör finnas tillgänglig under t.ex. /usr/share/doc/gtk-doc-tools/examples/Makefile.am. Om du har flera dok-paket, repetera detta för vart och ett.
Nästa steg är att redigera inställningarna inuti Makefile.am. Alla inställningarna har en kommentar ovanför som beskriver deras syfte. De flesta inställningarna är extraflaggor som skickas till respektive verktyg. Varje verktyg har en variabel på formen <VERKTYGSNAMN>_OPTIONS. Alla verktygen har stöd för --help för att lista de parametrar som stöds.