Intégration avec automake
First copy the Makefile.am from the examples sub directory of the gtkdoc-sources to your project's API documentation directory ( ./docs/reference/<package>). A local copy should be available under e.g. /usr/share/doc/gtk-doc-tools/examples/Makefile.am. If you have multiple doc-packages repeat this for each one.
L'étape suivante est de modifier les options dans le fichier Makefile.am. Toutes les options sont accompagnées d'un commentaire au-dessus qui explique leur fonction. La plupart des options sont des paramètres supplémentaires qui sont passés aux outils respectifs. Chaque outil possède une variable de la forme <NOM_DE_L_OUTIL>_OPTIONS. Tous les outils prennent en charge l'option --help qui affiche la liste des options prises en charge.